packages(“pheatmap”)## 載入R包library(“pheatmap”)## 輸入檔案exp ## 繪製熱圖pheatmap(exp,cellwidth=20, cellheight=10,cluster_cols=T,...
withinss”[6] “betweenss” “size” “iter” “ifault”(2)呼叫barplot函式繪製每個簇中心的條形圖:> barplot(t(fit$centers),...
作者給出了一些資料集中cluster個數和聚類step的關係圖:2、快速:本文的方法不需要計算所有sample之間的距離,只需要找到每個sample的最近鄰即可...
Embedding utilization can reflect computational efficiency:每次用到的時候例項化避免無用的多次去獲得鄰居節點的資訊,想讓mini-batch sgd有效...
不斷的重複 recalculate和reallocation的過程,知道得到的centriods不在變化/移動為止 (convergence)evaluate clustering performance 看WGSS-BGSS rartio...
labels_# 呼叫輪廓係數分數,注意,silhouette_score生成的是所有樣本點的輪廓係數均值# 兩個需要輸入的引數是,特徵矩陣X和聚類完畢後的標籤silhouette_avg=silhouette_score(X,clust...