【科普】包病毒的原件你認識幾個?
很多同學包病毒的時候一般照著protocol就能完成了,但是卻不知道那些plasmid包括了病毒需要哪些原件。今天給大家科普一下。
用的最廣的是
二代包病毒系統
,通常由三個部分組成:
Packaging plasmid:比如 psPAX2,其中包括HIV
gag, pol, rev,
tat
tat是用來啟用
transfer plasmid
Envelop plasmid: 比如pMD2。G,裡面包括
VSV-G
Transfer plasmid:兩段LTR中間,夾著promoter驅動的cDNA或者shRNA
其中5‘LTR需要靠tat的表達才能啟用下游
對於shRNA來說,用的promoter一般是U6或H1,可以驅動Pol
III。
對於cDNA來說,用的promoter一般是CMV或者RSV,可以驅動Pol
II。
接下來是三代包病毒系統,它比二代更加安全,效率卻沒有二代高。
為什麼說它更加安全了呢?
這就要說到
病毒感染
的本質了。
它的本質是把自己的序列整入宿主的序列。
如果只有transfer plasmid中的序列整入進宿主的話,那麼它是無法再次變成病毒的,因為其他packaging和envelop的序列沒有被整入。
如果要想讓宿主自己產生病毒,需要滿足一個很艱難的條件,就是要把transfer,packaging和envelop三個plasmids中的序列
同時recombine進入宿主
。
那為什麼說三代更安全呢?
因為三代裡把packaging分成了兩個部分,一個有Rev,另一個有Gag和Pol。
因此所有plasmid加在一塊後,就有四個plasmids了,進而加大了四個同時recombine的難度。
同時,透過修改transfer中的5’LTR使其不再依賴HIV tat來啟用下游,三代系統摒棄了packaging裡面的tat,因此安全係數進一步提升。
這裡注意一下,如果你的vector是三代的(即有不需要依賴tat啟用的5‘LTR),那麼有沒有tat都無所謂,所以二代系統三代系統都能用。
但如果你的vector是二代的,也就是正常的5’LTR,你還是需要tat的表達的,因此只能用
二代系統
。
問答時間
Lentivirus 和retrovirus有什麼區別呢?
Lenti是retro的一種,要真說和標準retro的區別的話,那麼就是lenti可以感染
non-dividing
和dividing的細胞,而retro只能感染dividing的細胞,所以lenti的作用更廣。
二者都用gag,pol,rev來package,但是因為是不同的病毒,所以用的會有細微的差別(不同的isoform)。
2。 你直接用你的lentivector做一個瞬轉成不成?
答案是不推薦。因為很可能由於LTR(比如二代的需要依賴tat),沒有tat的情況下,基因表達量會很低。
最後給大家上一個transfer plasmid中lentivirus原件的表格,對於構建一個transfer plasmid很有用哦。
是不是很簡單呢?科科。
Reference
Addgene Lentiviral Guide