|撰文：莫北

我們拍攝的顯微鏡（如熒光顯微鏡，電鏡等）照片，一般會用顯微鏡配套的拍攝軟體在照片的固定位置（如右下角）加上標尺（Scale bar）。

但在我們展示的時候，往往需要將照片進行裁剪和排版，照片右下角的標尺往往會被裁剪掉。

那麼，

這時候如何給照片再加上標尺呢？甚至如何自由設定標尺的大小、實現下圖這般的標尺長度“整齊劃一”？

PNAS，2014

在《如何手動給顯微鏡照片加標尺？》一文已經介紹過如何使用Photoshop手動新增標尺，接下來為大家介紹一種更簡單的方法。

這次我們用到的軟體是ImageJ，軟體教程、安裝包與範例照片連結：

https：//www。

omicshare。com/forum/thr

ead-2783-1-1。html

首先，透過File/Open開啟需要處理的圖片，然後使用放大工具（工具欄第10個，快捷鍵：Ctrl+“+”放大，Ctrl+“-”縮小）放大圖片，重點是放大標尺區域，便於操作。

接下來是

設定標尺的真實單位

，也就是將圖片的畫素尺寸（pixels）換算為實際的物理尺寸，如這裡的微米。

方法是根據照片中的標尺，用直線工具畫一條與標尺等長的線段，然後透過Analyze/Set Scale，設定換算關係，（如果選擇“Global“，接下來的照片都以此標準進行換算，直到關閉軟體），點OK 完成設定。注意，雖然單位輸入的是“um”，但imageJ會自動轉換為“µm”，這一點非常人性化！

接下來使用矩形工具框選保留區域（同時按下Shift鍵繪製正方形選區），就可以透過Image/Crop隨意裁剪照片啦，如下，就可將顯微照片裁剪成方形的。

完成裁剪後，接著透過Analyze/Tools/Scale Bar為裁剪後的照片新增標尺。

在彈出的Scale bar視窗中，你可以設定標尺的實際大小、粗細、字型的大小、顏色、位置、樣式等，具體如下。

其實，標尺的新增位置不僅僅是Location選項中的4種，你也可以在照片的任意位置新增標尺。

你可以在任意位置繪製矩形選區，Location選擇At Selection，然後將標尺新增的選區中，具體方法如下。

最後，透過File/Save as匯出所需格式的照片即可。

以上就是使用ImageJ為顯微照片新增的標尺的方法，是不是非常簡單呢？

還想看什麼生信工具課程？可以在評論區留言哦~

參考文獻

Yang L ， Qin L ， Liu G ， et al。 Myosins XI modulate host cellular responses and penetration resistance to fungal pathogens［J］。 Proceedings of the National Academy of ences of the United States of America， 2014， 111（38）：13996-4001。