不知道基因序列怎麼設計引物?34781124162021-11-04 08:44:16

1、引物長度一般在15-30bp。常用的為18-27bp,因為過長會導致其延伸溫度大於74℃,不適於Taq DNA聚合酶進行反應。

2、引物GC含量一般為40%-60%, 45-55%為宜,GC含量過高或過低都不利於引發反應,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近,一般Tm值不超過5℃。

3、引物所對應的模板序列的Tm值在55-80℃之間,最好為72℃左右。

4、引物的延伸是從3′端開始的,不能進行任何修飾,且 3’端的鹼基一般不用A;引物3’端出現3個以上的連續鹼基,如GGG或CCC,或者引物3’端的互補、二聚體或髮夾結構也可能導致PCR反應失敗。

5、鹼基要隨機分佈,且引物自身和引物之間不能有連續4個鹼基的互補。

6、儘量在基因的編碼區(CDS序列)上設計引物,限制基因組DNA擴增。

7、使用BLAST檢索,確認引物特異性。