對於一條新發現的長鏈RNA,怎樣確認是編碼RNA還是非編碼RNA?Jangene2017-12-29 11:45:30

對於新發現RNA,如果該RNA具有編碼功能,那就具有較大的可能性在現在已知的蛋白資料庫中比對上相似的蛋白序列。其二,檢視時候具有完整的開放性閱讀框(Open Reading Frame, ORF),包含起始密碼子和終止密碼子。

對於一條新發現的長鏈RNA,怎樣確認是編碼RNA還是非編碼RNA?HJ2018-03-28 17:48:35

首先需要經過生物資訊分析,比如進行序列比對和翻譯,確認這條序列沒有比較長的完整編碼區,然後需要將這段序列克隆到真核表達載體中進行真核細胞內表達翻譯,此載體帶有標籤蛋白,以便後續的western檢測。也可以採用真核無細胞表達系統進行表達翻譯實驗,同時設定陽性對照。例如確定能成功表達出蛋白的GFP序列,以相同的條件克隆到表達載體並進行體外表達實驗。最後經過抗體檢測標籤蛋白序列,看目的序列是否能表達出蛋白條帶,如果沒有條帶被雜出來而陽性對照有條帶,才可以確定這條序列是長鏈非編碼RNA。