Prism作圖與統計教程（二）
上一期我們對Prism統計做了一個簡單介紹並舉了兩個例子（見第二條推送）。沒想到有興趣和有疑問的同學還挺多，也有同學給我們留言儘快更新。今天我會接著上一期的內容，對Prism做統計進行深入的學習。
上期內容開始貼了一張常用統計方法的圖，然後簡單舉了兩個例子。在推送之後有疑問的同學比較多，因此本篇內容根據讀者的疑問，和上期統計方法的圖進行說明，希望能讓大家更準確的選擇合適的統計方法。
一、T檢驗的使用（含非引數檢驗）
1．T檢驗主要用於
樣本含量較小
（一般 < 30），且總體
標準差未知
的正態分佈；用於檢驗
兩個總體均值
差異是否顯著。所以，T檢驗的前提是：1）隨機樣本來自
正態分佈
總體。2）兩個樣本總體具有
方差齊性
。
2．T檢驗包括配對T檢驗和非配對T檢驗（亦稱獨立樣本t檢驗）。配對T檢驗適用於配對設計樣本均數的比較。而非配對t檢驗適用於完全隨機的兩樣本均數的比較。
3。 如果兩組資料不服從正態分佈或方差齊，則採用非引數檢驗。
兩組資料的非引數性檢驗一般採用Mann-Whitney-U-test （也稱Mann–Whitney–Wilcoxon， Wilcoxon rank-sum test或Wilcoxon–Mann–Whitney test）和Wilcoxon-signed-rank-test。區別在於前者用於兩組樣品（類似於unpaired），而後者主要用於成對樣本（類似於Paired）。資料可以用Mean ± SD表示，但更多用Median with interquartile range表示。
4。 T檢驗舉例參見上期內容（
Prism做統計瞭解一下？
）。
二、雙因素方差分析（Two-way ANOVA）
1。 對
兩個以上
相互
獨立的隨機樣本
平均數進行假設檢驗的方法，主要是運用方差分析。當樣本只受一個因素影響時會採用
上期
說到的單因素方差分析
（One-way ANOVA）
，而受
兩種因素
影響時則採用雙因素方差分析
（Two-way ANOVA）
。
2。 單因素方差分析和雙因素方差分析的異同在於：
1）兩者樣本均來自正態分佈的相互獨立隨機樣本，且具有方差齊性（雙因素分析中有一個自變數的殘差符合即可）；2）雙因素方差分析的樣本必須存在兩個變數，且具有相互獨立的觀測值。同時兩個自變數都是分類變數，且因變數是連續的。3）上期也提到的單/雙因素方差分析一定要做事後比較。
3.
每個受試物件在不同時間點進行了
重複測量時
採用
重複測量方差分析
（Repeated measurement ANOVA）。如不同組別大鼠不同時間體重變化、腫瘤生長曲線、細胞增殖實驗等。
3.
雙因素方差分析舉例。
我們分析不用時間點（14、28和42 d），兩組（對照組和H2S組）資料中SOD的含量。所以本實驗中SOD含量受兩種因素即時間和組別，所以我們採用雙因素方差分析。首先建立group分組資料，如下圖所示。
1）選擇Analyze選項，進入分析介面，按下圖所示。第一個選項卡是實驗設計，我們選擇的是“行方向上是不同時間點”。
其他實驗設計選項卡按預設設定RM analysis 和Factor names設定如下。Factor names可以設定，也可以不設定。
最重要的是多重比較的選擇，在這裡我們把所有選項做一個簡單說明，如下圖所示。本實驗中是每行即同時間點進行比較。事後比較選擇Bonferroni選項。
所有選項先擇完畢，點選確定就輸出實驗結果了。先是雙因素分析的總體結果，右側上方是多重分析的結果。相應的結果圖會在下方Graphs輸出，稍加修改即可輸出。
計量資料的統計方法總結如下：
三、卡方檢驗（Chi-squared test）
比較兩個及兩個以上樣本率（構成比）以及兩個分類變數的關聯性分析。多用於涉及臨床病理特徵分析。
1。
兩個率或兩個構成比
的比較採用四格表資料的卡方檢驗。一般要求樣本量大於40，且每個格子中的理論頻數不應小於5。當樣本含量大於40但理論頻數又小於5時卡方值需要校正，當樣本量小於40時只能用Fisher精確檢驗。
2。
兩個率或兩個構成比以上
的比較用R*C列聯表的卡方檢驗。要求每個格子中的理論頻數T＞5或1 3. 卡方檢驗舉例 我們模擬兩個構成比的四格表卡方檢驗。比較A、B兩種藥物對大腸桿菌的抑菌（Y表示抑制，N表示無抑制）效果。首先資料格式選擇Contingency Table，模擬資料如下。之後點選分析，選擇卡方檢驗。進入分析選項卡。 進入選項卡後，選擇卡方檢驗（超過40，頻數>5）、雙尾檢驗（預設），然後點選確定，顯示分析結果。 輸出結果包含，卡方值、P value、檢測方法（雙尾）、95% CI等。若為列聯表分析，則還包含OR值。最終差異顯著性應以P value和OR值綜合考量。最後是圖片輸出，在這裡不再贅述。 本期內容先跟大家分享到這裡，接下來第三期內容我們會跟大家分享多元統計方法的選擇和應用。歡迎大家繼續關注我們公眾號，如果覺著內容對你有幫助，也請大家將我們的資源分享給更多的小夥伴，關注投必得獲得更多幹活內容！ 系列相關推送： 都9102年了還在用SPSS做統計？Prism瞭解一下 https：// zhuanlan。zhihu。com/p/86 348651
